More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1882 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 355 aa  701    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  41.14 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  37.89 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  43.57 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  46.98 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  42.82 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  40 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  38.58 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  34.56 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  35.98 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  35.98 
 
 		 353 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  39.05 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  39.77 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  36.93 
 
 		 345 aa  225  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  39.78 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1056  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  43.07 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1055  ABC transporter related  38.82 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.98 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0998  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  42.48 
 
 		 364 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  40.51 
 
 		 357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1059  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.48 
 
 		 364 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  39.61 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1735  ATP-binding component of transport system for maltose  38.46 
 
 		 376 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  37.39 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.38 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  34.44 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  40.38 
 
 		 366 aa  212  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.2 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  38.87 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  39.87 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.93 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  38.87 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  37 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.1 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  38.56 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0505  ABC transporter related  35.61 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.940496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  38.56 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  38.56 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  36.84 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  37.63 
 
 		 354 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 351 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.59 
 
 		 367 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  39.64 
 
 		 364 aa  205  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  36.66 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  45.2 
 
 		 361 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.36 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  42.46 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  36.06 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.91 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.54 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  41.96 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.89 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  40.51 
 
 		 542 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.84 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.31 
 
 		 355 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  36.69 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.39 
 
 		 379 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.28 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.76 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2057  ABC transporter related protein  44.16 
 
 		 327 aa  202  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0901178  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  35.5 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3522  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.68 
 
 		 384 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  41.88 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  41.45 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  42.24 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  40.47 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.13 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.98 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  38.81 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2228  ABC transporter related  42.06 
 
 		 241 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0571204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.8 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  40.95 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  41.13 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  43.7 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.37 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  45.11 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1404  ABC transporter related  37.69 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0478366  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  36.09 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.1 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  37.9 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 333 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0593  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.38 
 
 		 360 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.04 
 
 		 331 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.06 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.14 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>