46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0429 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 		 405 aa  797    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  50.13 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  43.38 
 
 		 408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  42.14 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  48.24 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  35.15 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  31.03 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  29.83 
 
 		 452 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  28.97 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.44 
 
 		 466 aa  145  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  29.02 
 
 		 469 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  24.24 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  26.04 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  28.33 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  30.57 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  26.24 
 
 		 477 aa  116  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  27.12 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  29.54 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  22.78 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  23.13 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  24.48 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  23.24 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  29.08 
 
 		 515 aa  99.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  25.05 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  24.92 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  27.58 
 
 		 468 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  24.14 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  26.37 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  29.24 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  27.68 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  24.43 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  23.46 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  23.49 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  23.06 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  31.51 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.38 
 
 		 580 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.53 
 
 		 566 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  27.04 
 
 		 566 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.99 
 
 		 579 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.89 
 
 		 811 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2099  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.56 
 
 		 669 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.339725  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.57 
 
 		 582 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.36 
 
 		 846 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.51 
 
 		 566 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.25 
 
 		 1035 aa  43.1  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.75 
 
 		 574 aa  43.1  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>