More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2494 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  47.98 
 
 
987 aa  822    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  97.78 
 
 
1035 aa  1988    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 
1322 aa  668    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  86.81 
 
 
995 aa  1696    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1059 aa  2117    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 
1313 aa  682    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
814 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  39.05 
 
 
1673 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  37.92 
 
 
1444 aa  349  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
1317 aa  341  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
1287 aa  337  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  37 
 
 
1314 aa  331  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  38 
 
 
1312 aa  329  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  38.77 
 
 
746 aa  323  8e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 
1185 aa  282  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
1008 aa  253  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
1256 aa  248  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
953 aa  233  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  37.21 
 
 
723 aa  205  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 
852 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 
827 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.8 
 
 
862 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
850 aa  174  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
818 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
818 aa  167  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  31.75 
 
 
849 aa  139  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
1067 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
857 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
1435 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
1600 aa  118  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  31.91 
 
 
1632 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  29.78 
 
 
2342 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  31.64 
 
 
597 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.91 
 
 
1806 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  29.78 
 
 
2342 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
1523 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
680 aa  103  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
1268 aa  102  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
1523 aa  101  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.45 
 
 
916 aa  99  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
785 aa  95.1  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.05 
 
 
1119 aa  93.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  38.38 
 
 
1247 aa  93.6  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
1044 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
658 aa  92  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
1162 aa  92.4  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
369 aa  91.3  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  29.51 
 
 
2796 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
665 aa  88.2  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  28.7 
 
 
387 aa  87.4  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.84 
 
 
1366 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
1340 aa  86.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
756 aa  84.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
872 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
535 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
1152 aa  79.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
1264 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
817 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
1152 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  35.04 
 
 
592 aa  76.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 
882 aa  73.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
1067 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
419 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  55.26 
 
 
115 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  61.9 
 
 
120 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
994 aa  71.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  26.55 
 
 
279 aa  70.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
457 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  35.37 
 
 
227 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  45.57 
 
 
294 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
280 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
293 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
303 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
746 aa  67.8  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
635 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
624 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  28.88 
 
 
235 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
336 aa  67.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.31 
 
 
860 aa  67.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  43.04 
 
 
294 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
1400 aa  67  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
616 aa  66.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  41.77 
 
 
294 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
1476 aa  66.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1106 aa  65.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  29.86 
 
 
223 aa  65.1  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
289 aa  64.7  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  31.71 
 
 
518 aa  64.7  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
300 aa  64.7  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
1303 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  35.23 
 
 
521 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
625 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
625 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
441 aa  62.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  35.44 
 
 
700 aa  62.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
679 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  36.07 
 
 
644 aa  61.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  30.61 
 
 
413 aa  60.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
273 aa  61.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>