260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0512 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 186 aa  246  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 179 aa  174  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  48.63 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  51.96 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  49.72 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  48.04 
 
 		 180 aa  161  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  46.37 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1634  CBS  26.49 
 
 		 457 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  30.3 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1558  putative transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.69 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  26.35 
 
 		 455 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  24.44 
 
 		 459 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  26.47 
 
 		 457 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.09 
 
 		 457 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  31.53 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2553  Cysteine synthase  26.43 
 
 		 457 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.4 
 
 		 453 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  28.67 
 
 		 455 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.77 
 
 		 342 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  28.67 
 
 		 455 aa  52  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.5 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  31.53 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  29.51 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  25.58 
 
 		 453 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 92 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  24.32 
 
 		 461 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  27.21 
 
 		 466 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  29.06 
 
 		 463 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  40.7 
 
 		 597 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  26 
 
 		 348 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  26.14 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  32 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 336 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  25.41 
 
 		 464 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 873 aa  48.9  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  24.29 
 
 		 459 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  26.45 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.77 
 
 		 863 aa  48.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 99 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  23.73 
 
 		 250 aa  47.8  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 101 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30.89 
 
 		 140 aa  48.1  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  27.87 
 
 		 464 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  25.87 
 
 		 875 aa  48.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  31.69 
 
 		 247 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  28.67 
 
 		 458 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  33.04 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 99 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  29.13 
 
 		 457 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.77 
 
 		 338 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.99 
 
 		 246 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  27.86 
 
 		 462 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 256 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 279 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  30.28 
 
 		 468 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 		 463 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.57 
 
 		 461 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  33.59 
 
 		 379 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.06 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  29.73 
 
 		 454 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  29.73 
 
 		 464 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  29.17 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.32 
 
 		 461 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  28.45 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.97 
 
 		 769 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  49.02 
 
 		 91 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  24.43 
 
 		 460 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 112 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  26.03 
 
 		 279 aa  45.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1696  CBS domain-containing protein  24.24 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000358324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  57.5 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  27.34 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  27.42 
 
 		 457 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.08 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>