More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2285 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  100 
 
 		 296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  60.81 
 
 		 295 aa  364  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  60.74 
 
 		 293 aa  359  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  60.61 
 
 		 295 aa  358  8e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 341 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  42.76 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  42.9 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  46.67 
 
 		 332 aa  221  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 274 aa  185  9e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 		 248 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 253 aa  179  7e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  38.84 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.46 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  37.5 
 
 		 244 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  36.48 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  39.04 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  34.96 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  36.4 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  36.64 
 
 		 244 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  40.65 
 
 		 261 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.29 
 
 		 245 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.45 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  36.28 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  35.78 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  31.91 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  35.71 
 
 		 244 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.9 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.84 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  35.34 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  33.11 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.61 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  37.05 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  36.16 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  36.16 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.61 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  31.25 
 
 		 313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  35.23 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  40.83 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  32.31 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  36.61 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  31.78 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  34.91 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  36.55 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  31.73 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  36.16 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  35.34 
 
 		 244 aa  165  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  36.16 
 
 		 244 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  40 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  39.82 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  38.73 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  36.7 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  37.84 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  36.16 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  33.56 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  36.32 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.12 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  36.61 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  37.72 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.19 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  37.23 
 
 		 589 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.6 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  38.01 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  35.27 
 
 		 244 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.56 
 
 		 236 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  39.82 
 
 		 240 aa  162  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.65 
 
 		 411 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  36.92 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  39.53 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  33.04 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  35.27 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.14 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  35.11 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  31.74 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  34.75 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 241 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  34.35 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  37.22 
 
 		 344 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.33 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  36.65 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.77 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  39.52 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.24 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  39.73 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  34.59 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>