More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2187 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  76.46 
 
 		 415 aa  670    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 417 aa  870    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1833  serine hydroxymethyltransferase  70.85 
 
 		 423 aa  624  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.785323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  71.94 
 
 		 436 aa  619  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1356  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0821973  hitchhiker  0.0000000382903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 414 aa  551  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 410 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 413 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 420 aa  522  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 416 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  62.16 
 
 		 413 aa  519  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 419 aa  511  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 412 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 418 aa  504  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 413 aa  501  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 412 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 		 413 aa  501  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 		 413 aa  502  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 415 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 414 aa  494  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 414 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.74 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  57.99 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  53.99 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 420 aa  488  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 		 426 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 411 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 423 aa  488  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  53.99 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  55.07 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  56.14 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  55.07 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 418 aa  478  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  53.75 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 423 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  53.56 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  57.99 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  56.02 
 
 		 413 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  53.51 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0413  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.774669  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 421 aa  468  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_378  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  54.04 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  55.01 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1580  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540119  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1035  Glycine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>