More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1167 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  100 
 
 		 293 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  43.91 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  46.01 
 
 		 263 aa  225  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  45.25 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  46.79 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  42.03 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  48.59 
 
 		 291 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  46.46 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  43.13 
 
 		 262 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  43.85 
 
 		 260 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  45.42 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  44.2 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  44.2 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  43.97 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  43.46 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  43.97 
 
 		 260 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  43.08 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  43.08 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  45 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  46.03 
 
 		 260 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  46.01 
 
 		 277 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  45.38 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  41.98 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  40.98 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  40.98 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  40.42 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  41.09 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  41.11 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  40 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  34.48 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  36.55 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  39.54 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  41.48 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  40.4 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  36.63 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  39.66 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  41.8 
 
 		 265 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  42.62 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  37.64 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  39.78 
 
 		 278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  36.43 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.43 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  35.02 
 
 		 276 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.83 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.84 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.84 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  39.04 
 
 		 287 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  33.47 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0237  ABC-3 protein  39.75 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468194 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  32.91 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  33.72 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  32.66 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.26 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.19 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2366  ABC-3 protein  38.66 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  32.26 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  32.26 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  32.26 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  32.66 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  32.26 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  33.46 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  32.66 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  29.17 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  31.87 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.96 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  33.47 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  31.14 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  34.03 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.76 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  31.01 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  32.53 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  30.08 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  32.08 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.47 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.47 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.47 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  32.79 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  32.62 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  32.91 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  29.68 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  33.19 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>