More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1166 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 385 aa  781    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  58.89 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  56.59 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  53.95 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  49.47 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  38.04 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  37.09 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  32.53 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  35.73 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 392 aa  166  8e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 386 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 		 385 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 391 aa  159  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  32.79 
 
 		 361 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  33.73 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  35.19 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  33.74 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.29 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  34.06 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  34.27 
 
 		 341 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.5 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.23 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  30.72 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.54 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.39 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  30.41 
 
 		 398 aa  116  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  29.22 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 407 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  25.67 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  33.63 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  31.72 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 399 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  23.72 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  31.91 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.09 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  30.22 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 		 398 aa  92.8  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 348 aa  90.1  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  27.47 
 
 		 375 aa  89.7  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.28 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.35 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  29.21 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  30.29 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.12 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.98 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.74 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.27 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.72 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.66 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  28.81 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.67 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  28.93 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  24.57 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  25.34 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.37 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  27.56 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  24.65 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.8 
 
 		 468 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>