More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2485 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  501  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  80.69 
 
 		 259 aa  409  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  68.33 
 
 		 241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  38.08 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  34.32 
 
 		 256 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  39.5 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  36.13 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  38.28 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  36.64 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  34.16 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 		 245 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.34 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.95 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.3 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.73 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.73 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.25 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  25.69 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  24.74 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  31.32 
 
 		 339 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 		 339 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  31.32 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.55 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.74 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  23.68 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  30.77 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  30.77 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.29 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  28.76 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.91 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  27.51 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  28 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.44 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.15 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 366 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.7 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  24.21 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  23.16 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  22.58 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  27.37 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  25.39 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  21.93 
 
 		 904 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.51 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  27.62 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.29 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 370 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0747  hypothetical protein  27.54 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  22.18 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 339 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 339 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  26.09 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  27.63 
 
 		 378 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  22.9 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 347 aa  52.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  24.65 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.78 
 
 		 396 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 371 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>