More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2178 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  100 
 
 		 422 aa  819    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  48.45 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  41.08 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  34.24 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  36.56 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 418 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  35.6 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  34.41 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  33.25 
 
 		 483 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  33.9 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  32.59 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.91 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  33.25 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  32.38 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  33.93 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  34.59 
 
 		 461 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  33.83 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  32.27 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  32.12 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  34.68 
 
 		 479 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  35 
 
 		 433 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  35.27 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  34.22 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  30.07 
 
 		 510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  31.88 
 
 		 482 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.85 
 
 		 500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  32.78 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  31.91 
 
 		 470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  33.58 
 
 		 438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 476 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.98 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.98 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  32.75 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  31.11 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  32.41 
 
 		 487 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  30.63 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 495 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  30.03 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 		 492 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 456 aa  155  9e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  34.71 
 
 		 478 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.82 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.79 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.79 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.82 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  34.02 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  29.05 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  28.54 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  30.77 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 539 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.15 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.79 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  28.54 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  30.85 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.05 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.82 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.67 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 476 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.67 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.82 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.9 
 
 		 471 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.19 
 
 		 476 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  27.23 
 
 		 463 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.6 
 
 		 494 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 488 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.16 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.98 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  27.13 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 		 518 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.06 
 
 		 463 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 468 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  30.96 
 
 		 451 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 		 468 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  29.08 
 
 		 468 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  32.62 
 
 		 437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  27.31 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  31.5 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>