203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1540 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  775    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  59.09 
 
 		 377 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  60.05 
 
 		 379 aa  456  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  39.16 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  37.4 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  36.32 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  35.34 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  36.7 
 
 		 376 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  36.08 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  36.81 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  35.36 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  35.09 
 
 		 375 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  34.91 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  35.66 
 
 		 384 aa  207  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  35.11 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  37.5 
 
 		 376 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  34.28 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  36.84 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  32.45 
 
 		 398 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  33.96 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  33.59 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  33.77 
 
 		 378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  33.94 
 
 		 378 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  31.16 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  30.37 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  30.85 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  31.54 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  32.37 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  31.09 
 
 		 323 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  31.23 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  30.86 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  32.45 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  30.12 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  32.69 
 
 		 261 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  32.69 
 
 		 261 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  32.24 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  30.66 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.64 
 
 		 618 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  33.2 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  31.13 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  26.3 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  28.14 
 
 		 442 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  33.06 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  31.62 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.36 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  27.83 
 
 		 316 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  29.26 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  32.38 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  27.27 
 
 		 375 aa  93.2  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  31.2 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  30.77 
 
 		 309 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  27.8 
 
 		 303 aa  89.7  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  30.09 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  26.32 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  26.74 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  26.43 
 
 		 307 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  27.41 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  30.42 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  30.42 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  28.63 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  29.1 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  28.99 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  28.02 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  36.6 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  25.81 
 
 		 308 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  27.24 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  26.17 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  39.13 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  39.13 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  40.91 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  26.47 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  27.04 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  25.51 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  42.11 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  26.25 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  24.63 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  27.1 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  27.64 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  25.44 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  28.78 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  24.18 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  25.7 
 
 		 305 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1783  hypothetical protein  25.7 
 
 		 263 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000128994 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  48.08 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.33 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.33 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.33 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  34.33 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  35.82 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.82 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  35.82 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  35.82 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  32.86 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  41.18 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  35.82 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.43 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  35.82 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  35.82 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0512  hypothetical protein  26.63 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0639953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>