More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02035 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  100 
 
 
411 aa  857    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  100 
 
 
411 aa  857    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  99.51 
 
 
411 aa  854    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  93.67 
 
 
411 aa  819    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  99.27 
 
 
411 aa  852    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  857    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  93.19 
 
 
411 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  93.19 
 
 
411 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  99.76 
 
 
411 aa  855    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  100 
 
 
411 aa  857    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  93.67 
 
 
411 aa  819    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  99.51 
 
 
411 aa  851    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  93.43 
 
 
411 aa  817    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  100 
 
 
411 aa  857    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.89 
 
 
432 aa  577  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.1 
 
 
434 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.25 
 
 
434 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.25 
 
 
434 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  44 
 
 
437 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  44.64 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  44.14 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.9 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.75 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.75 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.89 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  44.14 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.5 
 
 
438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.25 
 
 
444 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2712  dihydropyrimidine dehydrogenase  42.41 
 
 
434 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462922  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.25 
 
 
444 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1363  dihydropyrimidine dehydrogenase  42.44 
 
 
432 aa  331  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.709069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  42.5 
 
 
434 aa  330  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  42.09 
 
 
437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.14 
 
 
437 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.72 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  42.71 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.47 
 
 
437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.97 
 
 
424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.99 
 
 
437 aa  326  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.39 
 
 
425 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.9 
 
 
436 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0296  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.78 
 
 
436 aa  319  6e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.22 
 
 
424 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.66 
 
 
422 aa  319  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.78 
 
 
436 aa  318  7.999999999999999e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.79 
 
 
441 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  42.96 
 
 
424 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  42.96 
 
 
424 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.29 
 
 
439 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  42.71 
 
 
424 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2361  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.71 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  42.18 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  43.22 
 
 
424 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.34 
 
 
435 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.05 
 
 
442 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4151  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.27 
 
 
436 aa  282  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1889  dihydroorotate dehydrogenase family protein  39.57 
 
 
461 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0110983  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  34.68 
 
 
398 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.5 
 
 
301 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.63 
 
 
300 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.15 
 
 
304 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.08 
 
 
304 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.83 
 
 
304 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.94 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.35 
 
 
381 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.11 
 
 
307 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.15 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.14 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.6 
 
 
304 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.13 
 
 
305 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.52 
 
 
303 aa  136  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.1 
 
 
360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.45 
 
 
311 aa  133  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.5 
 
 
300 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  29.25 
 
 
303 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.93 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.89 
 
 
300 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0125  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.68 
 
 
308 aa  124  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000118304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  26.18 
 
 
390 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1161  dihydroorotate dehydrogenase family protein  29.6 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.109193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0785  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.44 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1183  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.09 
 
 
324 aa  116  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1820  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.94 
 
 
305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0131374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0389  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  31.21 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.42122  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1279  hypothetical protein  32.29 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  31.11 
 
 
352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.53 
 
 
304 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1197  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.98 
 
 
299 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.63 
 
 
305 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2665  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.73 
 
 
322 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1382  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.84 
 
 
299 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0126255  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1153  dihydroorotate dehydrogenase  33.64 
 
 
417 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00356185  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.35 
 
 
311 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1372  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.18 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000766739  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0796  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.58 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1841  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.15 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000167258  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  27.62 
 
 
314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1154  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.88 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43388  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.53 
 
 
297 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1814  dihydroorotate dehydrogenase 1B  32.05 
 
 
302 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00465279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>