72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1326 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  702    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1838  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 		 491 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  26.25 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  20.5 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 873 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  23.68 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  26.1 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  20.91 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  23.8 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  21.74 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  24.19 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  21.31 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  20.76 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  19.35 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  19.4 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  21.59 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  24.23 
 
 		 447 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 474 aa  53.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.76 
 
 		 561 aa  53.5  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 317 aa  53.5  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 347 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 465 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  21.58 
 
 		 451 aa  49.7  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 471 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  21.58 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  26.39 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  26.2 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 		 843 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  22.37 
 
 		 428 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  21.72 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  24.66 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  22.22 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2394  radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0630696  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  22.86 
 
 		 279 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  21.45 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 421 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  24.1 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 		 565 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  20.51 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  27.1 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 513 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2817  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  22.16 
 
 		 335 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 287 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  20.11 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>