261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0363 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  60.61 
 
 
567 aa  702    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  65.72 
 
 
564 aa  762    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  64.42 
 
 
574 aa  712    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  75.98 
 
 
564 aa  860    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  63.72 
 
 
575 aa  707    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  65.95 
 
 
582 aa  751    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  65.36 
 
 
563 aa  749    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  68.21 
 
 
566 aa  756    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  69.03 
 
 
564 aa  759    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  65.92 
 
 
620 aa  709    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  73.18 
 
 
566 aa  791    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  65.12 
 
 
568 aa  748    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  100 
 
 
563 aa  1097    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  52.9 
 
 
601 aa  555  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  50.78 
 
 
611 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  52.2 
 
 
588 aa  518  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  50.72 
 
 
592 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  50.09 
 
 
610 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  48.75 
 
 
585 aa  491  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  50.9 
 
 
586 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  47.06 
 
 
585 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  48.04 
 
 
585 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  45.93 
 
 
623 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  45.14 
 
 
553 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  46.48 
 
 
570 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  46.47 
 
 
562 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  44.62 
 
 
570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  45.39 
 
 
568 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  44.46 
 
 
547 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  44.79 
 
 
569 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  44.95 
 
 
570 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  44.22 
 
 
547 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  44.28 
 
 
547 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  44.28 
 
 
547 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  44.1 
 
 
547 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  44.28 
 
 
547 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  44.28 
 
 
547 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  43.3 
 
 
547 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  43.38 
 
 
548 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  43.38 
 
 
548 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  43.92 
 
 
547 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  43.38 
 
 
547 aa  425  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  43.87 
 
 
570 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  42.6 
 
 
550 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  42.05 
 
 
547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  43.04 
 
 
557 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  39.93 
 
 
590 aa  397  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  41.71 
 
 
578 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.75 
 
 
538 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  35.33 
 
 
570 aa  295  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  34.4 
 
 
563 aa  291  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  32.66 
 
 
511 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  31.25 
 
 
534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  33.06 
 
 
526 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  32.72 
 
 
548 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  30.97 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  29.91 
 
 
556 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  29.91 
 
 
556 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  29.74 
 
 
556 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  30.65 
 
 
559 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  30.26 
 
 
556 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  28.64 
 
 
551 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  28.64 
 
 
551 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  28.47 
 
 
551 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  28.3 
 
 
551 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  28.84 
 
 
530 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  30.37 
 
 
564 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  28.3 
 
 
551 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  27.95 
 
 
547 aa  167  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  28.06 
 
 
553 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  28.43 
 
 
560 aa  166  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  28.09 
 
 
565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  29.28 
 
 
570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  27.62 
 
 
553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  28.92 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  27.92 
 
 
560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  31.39 
 
 
504 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  27.81 
 
 
551 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  27.2 
 
 
589 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  26.91 
 
 
545 aa  163  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  27.68 
 
 
551 aa  163  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  27.68 
 
 
551 aa  163  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  27.68 
 
 
551 aa  163  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  27.68 
 
 
551 aa  163  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  27.68 
 
 
551 aa  163  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  27.68 
 
 
551 aa  163  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  28.71 
 
 
540 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.19 
 
 
545 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  27.51 
 
 
551 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  27.51 
 
 
551 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  27.91 
 
 
552 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  27.51 
 
 
551 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  28.74 
 
 
560 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  26.64 
 
 
506 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  28.74 
 
 
560 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  28.74 
 
 
560 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  28.74 
 
 
560 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  28.74 
 
 
560 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  28.74 
 
 
560 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  27.6 
 
 
552 aa  160  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>