More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0212 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0212  cysteine desulfurase  100 
 
 		 382 aa  751    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.133802  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  60.21 
 
 		 378 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  52.93 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.73 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  53.87 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  51.6 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  51.6 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  50.66 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50.53 
 
 		 407 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  51.47 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  53.48 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  50.94 
 
 		 389 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  49.21 
 
 		 402 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  50.93 
 
 		 401 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  50.4 
 
 		 400 aa  363  4e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  50.93 
 
 		 401 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  50.94 
 
 		 388 aa  362  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  51.74 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.73 
 
 		 398 aa  358  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  52 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  52.52 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  51.21 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  49.87 
 
 		 402 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  49.6 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  49.07 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.66 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  47.33 
 
 		 386 aa  347  3e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  49.06 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  48.8 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  47.47 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  50.4 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  53.03 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  51.56 
 
 		 410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  52.79 
 
 		 387 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  51.99 
 
 		 397 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  53.19 
 
 		 407 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  52.52 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  52.51 
 
 		 404 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  50.4 
 
 		 400 aa  328  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.06 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.47 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  50.66 
 
 		 407 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1537  cysteine desulfurase  52.67 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.417733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1253  aminotransferase class V  52.67 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.2 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.87 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  46.52 
 
 		 396 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  43.32 
 
 		 388 aa  312  6.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.12 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.62 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.63 
 
 		 409 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  43.05 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  52.69 
 
 		 404 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  51.35 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  44 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  48.94 
 
 		 380 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1412  aminotransferase class V  51.8 
 
 		 391 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  43.73 
 
 		 392 aa  302  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.69 
 
 		 398 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.71 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  43.88 
 
 		 400 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  43.85 
 
 		 398 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.75 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.21 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  43.88 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  46.54 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.93 
 
 		 414 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.51 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.44 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  45 
 
 		 392 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  46.67 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  41.99 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  50.68 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.82 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  46.36 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.19 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  45.08 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.48 
 
 		 404 aa  289  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  50.54 
 
 		 381 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  43.96 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.63 
 
 		 383 aa  285  7e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  41.6 
 
 		 402 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  43.01 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  45.63 
 
 		 1143 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  39.68 
 
 		 383 aa  282  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.69 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  46.47 
 
 		 1135 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  45.33 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.68 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.09 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.56 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.6 
 
 		 394 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  41.58 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  44.99 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  43.8 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.83 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  44.04 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>