More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4684 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4684  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 340 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5666  cobalamin synthesis protein/P47K  41.82 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  39.08 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  34.49 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  36.92 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  33.53 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  29.7 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  32.83 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  29.9 
 
 		 319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  37.08 
 
 		 364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  29.26 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.37 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.26 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.37 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  34.87 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  36.59 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.41 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.7 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.7 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  29.41 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.7 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  36.79 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 408 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  31.83 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  33.22 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  34.24 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  33.23 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  34.13 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 470 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.34 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  45.51 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  43.96 
 
 		 375 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  47.17 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  29.23 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.76 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  35.37 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  28.75 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.22 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  30 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  32.78 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.22 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  29.03 
 
 		 323 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  31.69 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  31.68 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  43.41 
 
 		 366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  45.28 
 
 		 377 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.22 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  34.67 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  32.89 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  32.87 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  33.64 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.43 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30.58 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  30.43 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  31.89 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  34.72 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  29.02 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.01 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  32.07 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  28.83 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  26.02 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  29.64 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  31.12 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  32.27 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  30.16 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  30.9 
 
 		 417 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  30.84 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  34.56 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  28.65 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  32.59 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  33.87 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  36.67 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  30.72 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  37.1 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  28.06 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  36.81 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  28.52 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  31.41 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  32.41 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  30.45 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3487  cobalamin synthesis protein, P47K  36.52 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  29.39 
 
 		 614 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31.1 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  29.5 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  38.42 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  36.84 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  27.73 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  36.52 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  27.36 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  29.64 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  28.45 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  37.02 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>