57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1522 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 512 aa  962    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  50.29 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  49.22 
 
 		 533 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  51.27 
 
 		 526 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  48.2 
 
 		 534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  48.77 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  49.28 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  48.3 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  46.58 
 
 		 491 aa  305  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  42.28 
 
 		 493 aa  293  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  36.61 
 
 		 498 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  42.28 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  41.54 
 
 		 498 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  33.59 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  40.5 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  29.69 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.29 
 
 		 317 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  34.38 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  30.57 
 
 		 315 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 284 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  34.48 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 302 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 296 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 305 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  29.22 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  32.67 
 
 		 254 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.63 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  36.75 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  30.51 
 
 		 254 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.2 
 
 		 372 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10718  predicted protein  27.08 
 
 		 279 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  27.86 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 279 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 317 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  30.17 
 
 		 310 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  31.82 
 
 		 312 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  30.08 
 
 		 968 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 284 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  44 
 
 		 277 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 287 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  28.57 
 
 		 274 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  33.33 
 
 		 281 aa  44.3  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  32.03 
 
 		 286 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  36.26 
 
 		 385 aa  43.9  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  34.78 
 
 		 253 aa  43.9  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 292 aa  43.5  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 284 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>