284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0175 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 567 aa  1149    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  51.67 
 
 		 567 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  50.19 
 
 		 552 aa  541  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  49.62 
 
 		 552 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  36.6 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  35.5 
 
 		 531 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  36.34 
 
 		 518 aa  263  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 		 531 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  34.88 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  36.91 
 
 		 540 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  35.14 
 
 		 521 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  35.24 
 
 		 515 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  34.94 
 
 		 521 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  37.31 
 
 		 715 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  34.51 
 
 		 521 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  35.23 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  36.13 
 
 		 520 aa  250  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  34.74 
 
 		 521 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  34.59 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  35.29 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  36.34 
 
 		 520 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  34.11 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  35.29 
 
 		 524 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  35.29 
 
 		 524 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  33.15 
 
 		 540 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06075  phenylalanine ammonia-lyase (AFU_orthologue; AFUA_2G09110)  32.99 
 
 		 701 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0383737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  35.08 
 
 		 524 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  33.19 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  35.08 
 
 		 524 aa  243  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  33.69 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  32.19 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  33.84 
 
 		 516 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 540 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  33.47 
 
 		 532 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  33.47 
 
 		 532 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  32.77 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  33.84 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  34.42 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03897  conserved hypothetical protein  33.61 
 
 		 686 aa  233  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000679647  normal  0.349897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  32.61 
 
 		 508 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  29.9 
 
 		 509 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  34.48 
 
 		 498 aa  227  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 504 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  36.56 
 
 		 509 aa  226  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  32.91 
 
 		 528 aa  226  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  34.26 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  34.19 
 
 		 513 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  31.24 
 
 		 506 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  32.8 
 
 		 526 aa  223  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  36.01 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  33.83 
 
 		 507 aa  221  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  32.2 
 
 		 505 aa  220  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  32.04 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  33.81 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  32.04 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  31.83 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  32.04 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  31.83 
 
 		 505 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  31.83 
 
 		 505 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 		 533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  30.49 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  34.03 
 
 		 489 aa  217  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  32.04 
 
 		 506 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  32.04 
 
 		 505 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  31.83 
 
 		 505 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  31.83 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  34.35 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  34.29 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  31.87 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  34.22 
 
 		 507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  34.15 
 
 		 507 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  34.35 
 
 		 523 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  31.74 
 
 		 502 aa  212  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  34.01 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  32.19 
 
 		 506 aa  210  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  34.62 
 
 		 511 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  34.62 
 
 		 511 aa  210  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  34.16 
 
 		 518 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  36.59 
 
 		 508 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  32.24 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  36.59 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  33.68 
 
 		 528 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 507 aa  207  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  33.81 
 
 		 507 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  33.81 
 
 		 507 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  31.93 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  34.49 
 
 		 505 aa  206  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  30.51 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  32.64 
 
 		 507 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  32.64 
 
 		 507 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  32.64 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  33.19 
 
 		 537 aa  205  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  32.45 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  32.45 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  32.45 
 
 		 529 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  34.42 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  31.49 
 
 		 513 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>