More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1652 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1652  HAD family hydrolase  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.65 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  32.71 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  27.49 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  29.44 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.28 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.95 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  25.79 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.5 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.75 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  29.5 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  25.93 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  29.58 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  29.58 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  28.84 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  30.66 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  30.66 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.06 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  32 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.85 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  30.94 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  27.27 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  28.64 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  27.86 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  26.87 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  31.7 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  30.49 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.33 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.17 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  28.57 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  26.48 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  30.57 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.57 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.6 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.84 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  27.48 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  25.93 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  29.21 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.41 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  26.74 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  24.65 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  27.01 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.59 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.41 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  29.32 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  25.97 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  25.97 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  23.04 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.26 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.26 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  25.97 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.21 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43120  phosphoglycolate phosphatase, PGPase  28.83 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  26.39 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  25.58 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>