More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1412 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1412  ammonium transporter  100 
 
 		 393 aa  777    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  52.17 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  43.11 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  40.87 
 
 		 411 aa  288  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  39.9 
 
 		 453 aa  286  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  41.41 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  40 
 
 		 467 aa  282  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  40.86 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  38.6 
 
 		 410 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  38.34 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  38.34 
 
 		 410 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  38.08 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  38.34 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  38.08 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  38.08 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  38.08 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  41.13 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  40.05 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  38.08 
 
 		 410 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  41.56 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  38.68 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  41.6 
 
 		 470 aa  265  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  40.52 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  38.56 
 
 		 463 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  39.6 
 
 		 504 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  38.62 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  38.04 
 
 		 444 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  38.04 
 
 		 478 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  38.04 
 
 		 500 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  38.04 
 
 		 466 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  38.04 
 
 		 500 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  38.04 
 
 		 466 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  38.04 
 
 		 466 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  39.95 
 
 		 438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  38.04 
 
 		 500 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  40.76 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  37.78 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  38.96 
 
 		 433 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  37.78 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  37.78 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  37.44 
 
 		 469 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  39.74 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  39.48 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  38.86 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  35.64 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  37.89 
 
 		 449 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  37.67 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  39.36 
 
 		 459 aa  253  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  38.42 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0443  ammonium transporter  42.15 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  37.75 
 
 		 445 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  38.3 
 
 		 438 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  38.3 
 
 		 438 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  36.43 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  38.82 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  37.85 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  39.85 
 
 		 503 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1347  ammonium transporter  41.22 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2232  ammonium transporter  37.76 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  38.07 
 
 		 466 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  37.47 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  39.85 
 
 		 497 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  41.02 
 
 		 466 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  37.78 
 
 		 502 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  37.63 
 
 		 499 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  41.14 
 
 		 466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  38.4 
 
 		 435 aa  246  6.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  38.19 
 
 		 439 aa  245  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  38.17 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1337  ammonium transporter  40.25 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  38.08 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  36.99 
 
 		 436 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  35.09 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  36.52 
 
 		 501 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  37.73 
 
 		 431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  41.14 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  41.14 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  37.18 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  41.14 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  37.18 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  37.18 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  37.18 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  37.18 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  37.41 
 
 		 439 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  40.84 
 
 		 437 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  37.79 
 
 		 433 aa  239  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  37.95 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  37.4 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  36.84 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  37.12 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  35.59 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  35.99 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  37.95 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  37.95 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  37.95 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  37.95 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  37.95 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  37.69 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  37.69 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1498  ammonium transporter family protein  36.69 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.943229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>