39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0143 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1108    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  37.24 
 
 		 636 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  36.39 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  34.28 
 
 		 628 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  37.68 
 
 		 597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  26.25 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  26.9 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  31.25 
 
 		 625 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  32.36 
 
 		 630 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  26.46 
 
 		 500 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  27.47 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  26.21 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  28.34 
 
 		 616 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  34.98 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  34.98 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  34.98 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  37.89 
 
 		 280 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  30.53 
 
 		 316 aa  140  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  34.3 
 
 		 295 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  24.38 
 
 		 569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  25.55 
 
 		 591 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  25.48 
 
 		 561 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  25 
 
 		 515 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  23.35 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  26.56 
 
 		 610 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  26.89 
 
 		 338 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  26.14 
 
 		 617 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  30.97 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  31.76 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  25.33 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  30 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  29.52 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  22.57 
 
 		 579 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  23.97 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  26.95 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  29.65 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  22.28 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  23.92 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  24.16 
 
 		 523 aa  56.6  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>