50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3046 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  100 
 
 		 760 aa  1488    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  37.98 
 
 		 730 aa  344  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  26.34 
 
 		 692 aa  184  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  28.75 
 
 		 656 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  26.28 
 
 		 649 aa  136  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  28.03 
 
 		 653 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  28.31 
 
 		 650 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  32.04 
 
 		 651 aa  127  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1080 aa  118  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1203 aa  114  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1008 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  32.53 
 
 		 677 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  29.75 
 
 		 649 aa  97.8  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  46.36 
 
 		 785 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  26.51 
 
 		 647 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  28.53 
 
 		 652 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  40 
 
 		 644 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  32.54 
 
 		 796 aa  92.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  39.23 
 
 		 676 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  27.19 
 
 		 737 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  39.23 
 
 		 676 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1119 aa  91.3  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  43.24 
 
 		 650 aa  89  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  37.12 
 
 		 706 aa  87.4  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  27.74 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  45.16 
 
 		 843 aa  80.5  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  35 
 
 		 854 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1101 aa  77.8  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1022 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  46.15 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1235 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1332 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1744 aa  61.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1183 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1236 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1168 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  29.46 
 
 		 1007 aa  55.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  25.15 
 
 		 469 aa  55.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1252 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  35.04 
 
 		 833 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1258 aa  54.3  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  25.29 
 
 		 469 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  35.64 
 
 		 833 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  29.12 
 
 		 986 aa  49.3  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  27.69 
 
 		 469 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1088 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  35.24 
 
 		 503 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  28.57 
 
 		 503 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1124 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1413 aa  45.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>