More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1241 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
182 aa  363  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.2 
 
 
178 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.88 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.96 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.72 
 
 
178 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
180 aa  104  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
180 aa  103  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.89 
 
 
180 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  30.17 
 
 
180 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  34.86 
 
 
176 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
186 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  32.18 
 
 
188 aa  97.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.21 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 
182 aa  94.4  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
186 aa  92  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
180 aa  91.3  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  28 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  30.51 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
179 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
180 aa  88.6  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
180 aa  88.6  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
181 aa  88.2  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.82 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
183 aa  87.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  30.86 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.23 
 
 
178 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
179 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  28.99 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  28.98 
 
 
178 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
186 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2328  ATP synthase F1, delta subunit  33.91 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000241371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.48 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  28.65 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  27.27 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  26.63 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.03 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03619  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00523657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4232  ATP synthase F1, delta subunit  29.82 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245958  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3951  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000356722  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03563  hypothetical protein  29.82 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00259121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5171  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00189703  decreased coverage  0.00512499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4251  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4186  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000191061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4259  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000372939  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00374645  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  29.17 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  31.79 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
186 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  28.9 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4544  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0114562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>