More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0438 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0438  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 		 942 aa  1925    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00387795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  39.12 
 
 		 916 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  37.16 
 
 		 918 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0159  penicillin-binding protein 1B, putative  35.94 
 
 		 765 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201709  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1846  penicillin-binding protein 1B  37.66 
 
 		 807 aa  452  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0432  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.5 
 
 		 812 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29 
 
 		 765 aa  270  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  29.25 
 
 		 761 aa  257  8e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  28.66 
 
 		 828 aa  254  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  30.59 
 
 		 934 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.47 
 
 		 905 aa  250  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  28.36 
 
 		 727 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  30.85 
 
 		 727 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 		 795 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.64 
 
 		 687 aa  239  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  27.41 
 
 		 814 aa  238  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  29.15 
 
 		 941 aa  234  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  28.76 
 
 		 712 aa  233  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  29.09 
 
 		 796 aa  228  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  30.18 
 
 		 680 aa  228  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.53 
 
 		 685 aa  228  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  29.76 
 
 		 721 aa  228  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  29.85 
 
 		 679 aa  228  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  30.38 
 
 		 667 aa  227  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  27.94 
 
 		 705 aa  227  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  30.21 
 
 		 680 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  30.05 
 
 		 680 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  28.9 
 
 		 679 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 680 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  30.21 
 
 		 680 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  30.2 
 
 		 709 aa  225  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  29.8 
 
 		 648 aa  225  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  30.21 
 
 		 680 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 673 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 673 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  27.53 
 
 		 843 aa  222  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  30.28 
 
 		 846 aa  222  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  30.23 
 
 		 834 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 646 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  30.23 
 
 		 820 aa  222  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.21 
 
 		 806 aa  221  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  28.38 
 
 		 746 aa  221  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  30.08 
 
 		 834 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.35 
 
 		 648 aa  220  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  30.08 
 
 		 835 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.51 
 
 		 643 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  28.79 
 
 		 794 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  28.52 
 
 		 625 aa  217  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  29.53 
 
 		 837 aa  217  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  29.38 
 
 		 837 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  30.09 
 
 		 638 aa  213  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  29.98 
 
 		 743 aa  213  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  28.1 
 
 		 705 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  28.51 
 
 		 705 aa  213  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  28.51 
 
 		 705 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  28.51 
 
 		 705 aa  213  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.35 
 
 		 642 aa  212  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  30.21 
 
 		 901 aa  213  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  28.51 
 
 		 705 aa  211  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  28.51 
 
 		 705 aa  211  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  30.13 
 
 		 658 aa  211  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  28.44 
 
 		 829 aa  211  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.42 
 
 		 661 aa  211  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  31.08 
 
 		 811 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  29.38 
 
 		 775 aa  210  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  28.93 
 
 		 645 aa  209  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  29.11 
 
 		 746 aa  209  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  29.4 
 
 		 728 aa  209  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  29.79 
 
 		 691 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  29.59 
 
 		 602 aa  209  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  28.98 
 
 		 832 aa  209  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  29.54 
 
 		 705 aa  208  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  28.73 
 
 		 705 aa  209  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  28.96 
 
 		 830 aa  208  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  28.72 
 
 		 679 aa  208  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  30.26 
 
 		 760 aa  208  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 727 aa  208  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 727 aa  208  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  28.07 
 
 		 618 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  30.38 
 
 		 641 aa  208  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  27.81 
 
 		 643 aa  208  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  27.81 
 
 		 643 aa  208  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  28.98 
 
 		 640 aa  207  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  31.02 
 
 		 643 aa  207  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  29.45 
 
 		 655 aa  206  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  31.02 
 
 		 643 aa  207  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  28.89 
 
 		 861 aa  207  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  28.01 
 
 		 718 aa  206  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 839 aa  206  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  29.93 
 
 		 708 aa  206  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  27.87 
 
 		 751 aa  205  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  29.17 
 
 		 727 aa  205  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  28.83 
 
 		 912 aa  205  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.79 
 
 		 642 aa  205  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  29.27 
 
 		 727 aa  204  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  28.7 
 
 		 741 aa  204  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  30.38 
 
 		 765 aa  204  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  30.38 
 
 		 784 aa  204  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  27.36 
 
 		 777 aa  204  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  29.34 
 
 		 654 aa  204  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>