More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0260 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  100 
 
 		 254 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  67.59 
 
 		 254 aa  345  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  58.89 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  59.29 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  55.34 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  49 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  49 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  53.91 
 
 		 264 aa  228  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 		 267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  50.44 
 
 		 264 aa  224  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  48.26 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  48.26 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  50.22 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  48.68 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  48.03 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  48.7 
 
 		 264 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  48.25 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  42 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  45.22 
 
 		 257 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  43.2 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 		 270 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  44 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  45.65 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  46.93 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  43.78 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  45.61 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  47.16 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  42.97 
 
 		 264 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  45.61 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  42.8 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  45.61 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  47.19 
 
 		 263 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  42.57 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  46.05 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  42.57 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  42.57 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  45.18 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  44.1 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  43.67 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  42.17 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  42.97 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  44.54 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  44.1 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  45.81 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  43.17 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  43.86 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  41.27 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  44.54 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  42.73 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  45.18 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 245 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  41.85 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  41.91 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  40.34 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  38.4 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  33.18 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  34.91 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  35.29 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  34.33 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  36.07 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  35.04 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.54 
 
 		 367 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  29.55 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.4 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 		 370 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  31.36 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.23 
 
 		 366 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  35.65 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  31.15 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  35.65 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>