More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0223 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0223  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
332 aa  665    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1738  polyprenyl synthetase family protein  35.78 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0352  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.95 
 
 
338 aa  187  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1465  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.17 
 
 
319 aa  184  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00436047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1084  polyprenyl synthetase  35.37 
 
 
326 aa  180  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1085  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.67 
 
 
325 aa  179  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.171148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 
322 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0190  prenyl transferase  36.64 
 
 
326 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.82 
 
 
326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  35.07 
 
 
318 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.43 
 
 
324 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  32.83 
 
 
324 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.13 
 
 
324 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.53 
 
 
321 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  34.36 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.18 
 
 
320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.34 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  32.74 
 
 
318 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.12 
 
 
320 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.02 
 
 
323 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.57 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  37.45 
 
 
323 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  33.79 
 
 
358 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.77 
 
 
323 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.77 
 
 
323 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.77 
 
 
320 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  35.56 
 
 
323 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.77 
 
 
320 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  29.72 
 
 
320 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.77 
 
 
320 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  32.84 
 
 
319 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  32.84 
 
 
319 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.42 
 
 
323 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  30.18 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  33.68 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.07 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  33.45 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.07 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  34.03 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.94 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.06 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.03 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.07 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  34.03 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.07 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  35.15 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  34.03 
 
 
342 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.1 
 
 
323 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.64 
 
 
323 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  31.8 
 
 
322 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.75 
 
 
323 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  33.67 
 
 
323 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.17 
 
 
337 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  34.6 
 
 
335 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  32.18 
 
 
313 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.97 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  34.27 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.38 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  34.27 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.25 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.97 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  30.18 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.62 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  31.6 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  32.98 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.62 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.87 
 
 
318 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  32.64 
 
 
322 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  31.62 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  32.17 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  29.72 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.82 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  30.45 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  37.21 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  37.14 
 
 
351 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  30.56 
 
 
334 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  31.46 
 
 
322 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  33.1 
 
 
336 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  30.82 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  28.66 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  31.53 
 
 
333 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  30.72 
 
 
334 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  36.74 
 
 
340 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  31.25 
 
 
336 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.69 
 
 
338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  31.36 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  32.76 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  30.9 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  31.49 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  31.82 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.84 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  30.14 
 
 
337 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  31.34 
 
 
989 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1972  trans-hexaprenyltranstransferase  31.77 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  32.2 
 
 
351 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  34.84 
 
 
311 aa  126  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  33.67 
 
 
327 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.23 
 
 
324 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  29.66 
 
 
341 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>