More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0122 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  56.15 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  54.88 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  49.3 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  48.2 
 
 		 279 aa  259  4e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  48.2 
 
 		 279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  48.2 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  48.94 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  48.99 
 
 		 297 aa  254  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  47.47 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  48.8 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  49.19 
 
 		 287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  41.64 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  42.14 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  42.14 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  36.08 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0438  antigenic protein  37.39 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657093  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1245  amino acid  36.29 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  31.93 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 267 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.96 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0813  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  31.6 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000481343  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  32.92 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.92 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.92 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  32.9 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  32.9 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  32.46 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.88 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  33.47 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  33.62 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  33.62 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  32.09 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.5 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.5 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  31.02 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.85 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.63 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  31.9 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.85 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  31.85 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.5 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.85 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.85 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.85 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.85 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  31.85 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.85 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  32.92 
 
 		 259 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  30.54 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6380  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6613  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0305717 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6211  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2462  extracellular solute-binding protein family 3  32.19 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2069  extracellular solute-binding protein family 3  32.19 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404874  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.1 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  31.28 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 292 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  31.28 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>