More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04160 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 249 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  59.72 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  53.5 
 
 		 254 aa  214  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  50.2 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  48.97 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  51.06 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  53.7 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  43.85 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  47.81 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  48.97 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30720  transcriptional regulator  57.94 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  38.38 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  38.38 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  33.06 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  30.57 
 
 		 308 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.8 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 276 aa  93.2  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 285 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 285 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  27.16 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  26.56 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 298 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 298 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  26.14 
 
 		 276 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 298 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.14 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.14 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.14 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.14 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.14 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  31.58 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.12 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  25.73 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  25.73 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  25.73 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  25.73 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  25.73 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  25.73 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  25.73 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  25.73 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  32.7 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  24.28 
 
 		 280 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  24.28 
 
 		 280 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  24.28 
 
 		 280 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 283 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  25.31 
 
 		 275 aa  85.5  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 294 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 274 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 316 aa  85.1  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.61 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>