More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2998 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 610 aa  1245    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  57.04 
 
 		 556 aa  608  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  53.32 
 
 		 556 aa  596  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  54.33 
 
 		 560 aa  564  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  48.96 
 
 		 553 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  48.23 
 
 		 554 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  47.82 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  45.57 
 
 		 566 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  45.77 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  44.21 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  43.68 
 
 		 561 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  41.98 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2548  extracellular solute-binding protein  41.8 
 
 		 584 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0070372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6149  extracellular solute-binding protein family 5  41.06 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2285  extracellular solute-binding protein family 5  41.13 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000852999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  34.31 
 
 		 534 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  33.82 
 
 		 535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 		 565 aa  271  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  32.38 
 
 		 524 aa  271  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 595 aa  260  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 525 aa  255  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  32.39 
 
 		 528 aa  247  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  32.57 
 
 		 529 aa  238  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  30.8 
 
 		 541 aa  226  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08450  Predicted extracellular solute-binding protein, family 5  29.77 
 
 		 554 aa  214  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.891256  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 538 aa  210  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  30.9 
 
 		 526 aa  205  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  31.12 
 
 		 532 aa  200  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 531 aa  197  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 547 aa  197  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.52 
 
 		 535 aa  196  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.33 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  29.33 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  29.33 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  29.33 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.33 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  29.33 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.33 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.58 
 
 		 535 aa  190  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  27.58 
 
 		 535 aa  190  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  27.58 
 
 		 535 aa  190  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 535 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 535 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.6 
 
 		 526 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.6 
 
 		 526 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.6 
 
 		 526 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.6 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.44 
 
 		 544 aa  189  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  28.85 
 
 		 523 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 535 aa  187  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.41 
 
 		 526 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 535 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 531 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.79 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.68 
 
 		 544 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 589 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 531 aa  183  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 544 aa  183  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 530 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 550 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 532 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 551 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.66 
 
 		 509 aa  180  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 531 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 531 aa  180  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.12 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.23 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.45 
 
 		 531 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 530 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 530 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 533 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.81 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 531 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 541 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.01 
 
 		 541 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 542 aa  176  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 581 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  28.68 
 
 		 506 aa  174  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 541 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 501 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  27.26 
 
 		 520 aa  173  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.02 
 
 		 510 aa  173  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>