More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1502 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  57.21 
 
 		 207 aa  228  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  58.21 
 
 		 204 aa  228  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  60.71 
 
 		 205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  59.31 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  52.8 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  54.9 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  51.16 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  52.28 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  48.78 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  55.39 
 
 		 211 aa  191  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  58.13 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  52.17 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  50.75 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  50.25 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  53.57 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  50.75 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  49.49 
 
 		 209 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  50.51 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  49.75 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  48.06 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  44.14 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  42.11 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  40.94 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  40.94 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  42.11 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  42.11 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  40.94 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  42.11 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  39.77 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  38 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  39.18 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  39.08 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  36.27 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  36 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  33.17 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  36.1 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  35.03 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  35.96 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  37.43 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  35.03 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  35.03 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  37.5 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  32.32 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  31.82 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  31.82 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  31.47 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  29.9 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  33.33 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  37.5 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  31.87 
 
 		 186 aa  94.7  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  29.94 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  28.92 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  31.64 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  31.37 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  31.64 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.64 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  27.59 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  34.97 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  30.51 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  31.25 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  37.23 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  35.44 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  35.19 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  35.4 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  36.69 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  30 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  34.57 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.12 
 
 		 320 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  30.07 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1941  methyltransferase small  33.33 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3978  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.65 
 
 		 343 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  30.67 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  28.67 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.79 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.39 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  27.97 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  31.15 
 
 		 353 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  31.37 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4140  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.9 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.449195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0687  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.64 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3335  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.64 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.533815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.29 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.64 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3032  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.5 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3164  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.64 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.94 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0597  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.67 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  30.96 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.94 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  30 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  45.35 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.21 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  44.05 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  44.79 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  32.33 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3372  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.05 
 
 		 378 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.04 
 
 		 347 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.71 
 
 		 333 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00279  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  28.67 
 
 		 360 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>