100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0378 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  49.25 
 
 		 687 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  100 
 
 		 687 aa  1410    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  49.04 
 
 		 701 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  47.08 
 
 		 671 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  47.59 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  47.45 
 
 		 678 aa  598  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  48.81 
 
 		 681 aa  596  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  44.38 
 
 		 677 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  44.56 
 
 		 682 aa  554  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  43.83 
 
 		 685 aa  534  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  42.73 
 
 		 685 aa  534  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  44.13 
 
 		 682 aa  532  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  43.56 
 
 		 711 aa  524  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  43.44 
 
 		 653 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  44.28 
 
 		 697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  41.87 
 
 		 663 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  42.66 
 
 		 672 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  41.63 
 
 		 657 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  41.25 
 
 		 662 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  41.86 
 
 		 667 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  41.49 
 
 		 667 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  39.32 
 
 		 691 aa  492  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  42.3 
 
 		 660 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  39.69 
 
 		 701 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  42.09 
 
 		 684 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  40.41 
 
 		 639 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  36.49 
 
 		 683 aa  468  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  42.19 
 
 		 697 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  39.29 
 
 		 710 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  38.47 
 
 		 678 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  40.56 
 
 		 663 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  36.69 
 
 		 686 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  41.75 
 
 		 680 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  35.04 
 
 		 679 aa  425  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  33.67 
 
 		 672 aa  415  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  33.67 
 
 		 672 aa  415  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  33.62 
 
 		 689 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  37.86 
 
 		 686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  32.61 
 
 		 689 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  37.82 
 
 		 685 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  41.29 
 
 		 686 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  35.67 
 
 		 688 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  35.88 
 
 		 690 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  34.84 
 
 		 672 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  33.67 
 
 		 669 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  33.77 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  33.77 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  34.02 
 
 		 686 aa  379  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  33.72 
 
 		 685 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  35.66 
 
 		 679 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  37.36 
 
 		 706 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  31.4 
 
 		 687 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  35.79 
 
 		 677 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  32.01 
 
 		 686 aa  359  8e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  32.37 
 
 		 669 aa  327  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  32.52 
 
 		 609 aa  317  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  32.98 
 
 		 649 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  32.8 
 
 		 649 aa  300  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  28.36 
 
 		 683 aa  301  4e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  33.44 
 
 		 700 aa  298  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  33.96 
 
 		 664 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  32.26 
 
 		 685 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  31.76 
 
 		 670 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  33.28 
 
 		 642 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  33.95 
 
 		 656 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  33.95 
 
 		 656 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  35.71 
 
 		 714 aa  275  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  30.67 
 
 		 644 aa  271  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  32.4 
 
 		 645 aa  270  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  33.51 
 
 		 646 aa  269  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  32.22 
 
 		 657 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  33.78 
 
 		 660 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  31.1 
 
 		 673 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  34.54 
 
 		 661 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  31.13 
 
 		 663 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  34.4 
 
 		 660 aa  257  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  33.05 
 
 		 635 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  33.04 
 
 		 663 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  35.42 
 
 		 656 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  30.19 
 
 		 652 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  35.19 
 
 		 664 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  35.19 
 
 		 664 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  34.22 
 
 		 656 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  30.49 
 
 		 635 aa  250  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  34.98 
 
 		 664 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  31.79 
 
 		 632 aa  244  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  29.13 
 
 		 710 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  28.21 
 
 		 710 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  27.45 
 
 		 669 aa  223  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  29.14 
 
 		 711 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  25.18 
 
 		 701 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  26.35 
 
 		 693 aa  193  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  23.7 
 
 		 674 aa  176  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  22.54 
 
 		 671 aa  164  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  27.99 
 
 		 699 aa  161  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  22.69 
 
 		 699 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  25.05 
 
 		 713 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  22.51 
 
 		 715 aa  98.6  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  25.34 
 
 		 640 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4692  hypothetical protein  22.33 
 
 		 721 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852935  normal  0.0295008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>