More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1475 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  69.33 
 
 
468 aa  643    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
468 aa  974    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  56.32 
 
 
469 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  55.34 
 
 
468 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  54.87 
 
 
468 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  43.16 
 
 
451 aa  347  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  42.26 
 
 
443 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  42.26 
 
 
443 aa  338  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  41.69 
 
 
446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  44.55 
 
 
446 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  45.43 
 
 
448 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  40.83 
 
 
469 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  43.69 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.73 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  43.9 
 
 
456 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.62 
 
 
459 aa  282  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  38.57 
 
 
449 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  38.36 
 
 
457 aa  281  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  39.31 
 
 
454 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.39 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  35.65 
 
 
474 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.44 
 
 
450 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.94 
 
 
443 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.22 
 
 
450 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  37.47 
 
 
449 aa  256  6e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.57 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.01 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.78 
 
 
452 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.35 
 
 
451 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.44 
 
 
451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  36.28 
 
 
452 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.89 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  23.68 
 
 
411 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  28.91 
 
 
1024 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
466 aa  96.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  33.52 
 
 
1024 aa  96.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.21 
 
 
989 aa  93.6  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  30.21 
 
 
1000 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.16 
 
 
475 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  25.48 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  34.34 
 
 
500 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.85 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  31.31 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  26.91 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  35.79 
 
 
497 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.5 
 
 
409 aa  83.2  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  25.37 
 
 
472 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.12 
 
 
499 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.65 
 
 
496 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  34.2 
 
 
503 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.54 
 
 
497 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0222  FAD linked oxidase domain protein  32.99 
 
 
502 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.5 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0417  FAD linked oxidase domain protein  31.44 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.589159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.83 
 
 
490 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  33.68 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0606  FAD linked oxidase-like  32.99 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.31 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.27 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  30.05 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.15 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0645  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.99 
 
 
511 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  31 
 
 
499 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  26.49 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.1 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1781  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.96 
 
 
501 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.44 
 
 
494 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  32.67 
 
 
495 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.68 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  31.5 
 
 
499 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  26.71 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.61 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.57 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.5 
 
 
499 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.88 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.47 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  29.07 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  28.78 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 
497 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  30.05 
 
 
492 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  31.47 
 
 
497 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.71 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  31.5 
 
 
499 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.33 
 
 
473 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  31 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  37.57 
 
 
461 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  30.46 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.96 
 
 
501 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.53 
 
 
492 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  31.86 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.05 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  34.2 
 
 
457 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 
497 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.05 
 
 
485 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  30.46 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  31.94 
 
 
503 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>