More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1453 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1453  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
317 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535565  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1594  dihydrodipicolinate synthetase  68.57 
 
 
317 aa  461  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4403  dihydrodipicolinate synthetase  63.09 
 
 
318 aa  431  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210844  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3897  dihydrodipicolinate synthetase  26.77 
 
 
320 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 
299 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
300 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
298 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 
292 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  27.04 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  29.19 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  26.95 
 
 
293 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  28.85 
 
 
296 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 
293 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  27.54 
 
 
300 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  28.85 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  33.74 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  33.74 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  27.1 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 
296 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  25.66 
 
 
294 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 
299 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  24.92 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  29.22 
 
 
293 aa  89.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0558  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.6555  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4352  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0532  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1696  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1740  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1674  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.954641  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1724  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  25.65 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 
298 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  32.34 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  27.33 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  25.33 
 
 
305 aa  85.9  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  24.07 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  26.95 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  26.62 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  25.86 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  25.85 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  24.68 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  26.2 
 
 
301 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  29.52 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  24.67 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  26.14 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  25.26 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  23.28 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  24.25 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  23.36 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  23.42 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  23.36 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  25.7 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  23.78 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  23.78 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  23.78 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  24.5 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  25.33 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  26.89 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4216  dihydrodipicolinate synthetase  25.42 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0462427  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  25.97 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  26.09 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  23.28 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  26.14 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  25.33 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  25.32 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  23.28 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  23.28 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  23.61 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  23.28 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  25.99 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  24.33 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>