103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0929 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0929  histidine kinase  100 
 
 
564 aa  1130    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  41.22 
 
 
515 aa  351  2e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
390 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  25.4 
 
 
588 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 
739 aa  68.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  25.09 
 
 
337 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 
563 aa  65.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.81 
 
 
572 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  27.54 
 
 
322 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
917 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  23.82 
 
 
391 aa  60.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2153  hypothetical protein  26.47 
 
 
148 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
450 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2626  hypothetical protein  35.24 
 
 
156 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.817414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 
729 aa  58.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2023  hypothetical protein  30.71 
 
 
209 aa  58.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2243  histidine kinase  26.27 
 
 
376 aa  58.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  28.33 
 
 
384 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  26.77 
 
 
265 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
748 aa  54.3  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  23.93 
 
 
385 aa  54.3  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  26.82 
 
 
557 aa  54.3  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 
516 aa  54.3  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0171  hypothetical membrane spanning protein  26.79 
 
 
148 aa  53.9  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  24.92 
 
 
343 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 
689 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  29.56 
 
 
1347 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
590 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0060  sensor histidine kinase  20.78 
 
 
348 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
490 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0052  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 
348 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
483 aa  51.6  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1473  histidine kinase  22.52 
 
 
422 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 
562 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  25.19 
 
 
484 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
1052 aa  50.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 
569 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
659 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 
655 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
438 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2425  membrane bound his kinase A  29.91 
 
 
350 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0749883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1125  hypothetical protein  34.92 
 
 
157 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.310685  normal  0.848341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 
638 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.96 
 
 
480 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
351 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 
587 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  25.5 
 
 
429 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  24.77 
 
 
541 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.26 
 
 
854 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  27.75 
 
 
506 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
590 aa  48.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.96 
 
 
1223 aa  47.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2652  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.55 
 
 
598 aa  47.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.29 
 
 
599 aa  47.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  25 
 
 
475 aa  47.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 
733 aa  47  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  23.05 
 
 
582 aa  47  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.79 
 
 
889 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.47 
 
 
348 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
757 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  25.88 
 
 
497 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1523  histidine kinase  20.58 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
700 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
594 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  18.67 
 
 
565 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  23.36 
 
 
477 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  23.9 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0054  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.47 
 
 
348 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.3 
 
 
456 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.37 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
592 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  24.58 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
570 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 
463 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
532 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  18.45 
 
 
381 aa  45.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 
534 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
532 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 
592 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.95 
 
 
708 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  22.39 
 
 
694 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
546 aa  45.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 
552 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 
586 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
517 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
655 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  21.34 
 
 
938 aa  44.3  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  22.96 
 
 
588 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
379 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
365 aa  44.3  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  31.03 
 
 
444 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  24.93 
 
 
383 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  25.66 
 
 
646 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.57 
 
 
754 aa  43.9  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
511 aa  43.9  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  24.47 
 
 
457 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.56 
 
 
1152 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  24.73 
 
 
483 aa  43.9  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>