42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3096 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  100 
 
 		 159 aa  317  5e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  83.65 
 
 		 159 aa  270  8.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  64.07 
 
 		 167 aa  216  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  68.75 
 
 		 160 aa  213  8e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  64.56 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  45.57 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  40.51 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  39.38 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  38.85 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  39.38 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  39.87 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  34.57 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  36.21 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  37.72 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  37.72 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  39.47 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  37.72 
 
 		 159 aa  84.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  43.04 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  29.14 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  36.73 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  37.21 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  27.54 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  31.45 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  34.34 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  28.49 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  35 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  30.18 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  46.77 
 
 		 633 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  25 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  31.71 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.21 
 
 		 580 aa  48.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  34.38 
 
 		 205 aa  48.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  32.91 
 
 		 466 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  30.34 
 
 		 464 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  28.97 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  32.91 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  36.92 
 
 		 472 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  34.18 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  35.79 
 
 		 469 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  37.5 
 
 		 469 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  33.87 
 
 		 634 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>