More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2399 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
860 aa  1743    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.97 
 
 
736 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  33.85 
 
 
739 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  32.02 
 
 
758 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  32.71 
 
 
750 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  31.94 
 
 
759 aa  365  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.61 
 
 
820 aa  354  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.09 
 
 
762 aa  343  7e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  31.48 
 
 
755 aa  336  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  33.69 
 
 
737 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
805 aa  318  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.23 
 
 
828 aa  308  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  31.57 
 
 
787 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.19 
 
 
749 aa  300  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.38 
 
 
765 aa  298  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.14 
 
 
783 aa  298  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  31.64 
 
 
750 aa  297  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  29.97 
 
 
743 aa  290  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.18 
 
 
801 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  31.27 
 
 
778 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.21 
 
 
804 aa  286  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  31.57 
 
 
772 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.15 
 
 
778 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.66 
 
 
733 aa  282  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  28.78 
 
 
772 aa  281  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  31.23 
 
 
738 aa  280  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.19 
 
 
777 aa  280  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  28.88 
 
 
765 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.79 
 
 
792 aa  279  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  30.5 
 
 
772 aa  278  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  30.33 
 
 
765 aa  277  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  29.9 
 
 
763 aa  277  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.81 
 
 
752 aa  276  9e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.75 
 
 
765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  28.75 
 
 
765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  28.48 
 
 
755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  28.75 
 
 
765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  28.48 
 
 
755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  30.08 
 
 
763 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.54 
 
 
751 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  28.18 
 
 
755 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  29.61 
 
 
808 aa  276  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.31 
 
 
765 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  30.08 
 
 
763 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.99 
 
 
751 aa  275  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  28.39 
 
 
766 aa  274  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  28.62 
 
 
765 aa  274  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.49 
 
 
790 aa  274  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  28.62 
 
 
765 aa  274  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.62 
 
 
765 aa  274  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  28.62 
 
 
765 aa  274  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  30.38 
 
 
743 aa  273  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  28.36 
 
 
755 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  28.05 
 
 
765 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.7 
 
 
766 aa  273  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  28.62 
 
 
765 aa  273  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  30.61 
 
 
721 aa  273  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  29.48 
 
 
774 aa  272  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  30.03 
 
 
763 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26742  beta-glucosidase  27.92 
 
 
953 aa  271  4e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  29.4 
 
 
743 aa  271  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.38 
 
 
768 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.89 
 
 
756 aa  269  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.19 
 
 
769 aa  269  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  29.34 
 
 
740 aa  268  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.63 
 
 
762 aa  267  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  31.32 
 
 
723 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  29.55 
 
 
859 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.48 
 
 
702 aa  265  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 
753 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31 
 
 
754 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  29.36 
 
 
765 aa  264  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  31.64 
 
 
618 aa  263  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  28.04 
 
 
765 aa  262  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.19 
 
 
769 aa  260  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.36 
 
 
784 aa  259  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.42 
 
 
771 aa  259  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1800  beta-glucosidase  30.81 
 
 
739 aa  257  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  30.86 
 
 
768 aa  256  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1732  glycoside hydrolase family 3 protein  31.19 
 
 
740 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.65 
 
 
733 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 
764 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 
763 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.93 
 
 
799 aa  254  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.34 
 
 
757 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  30.45 
 
 
862 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.13 
 
 
850 aa  252  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  27.59 
 
 
745 aa  251  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.96 
 
 
615 aa  251  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.85 
 
 
900 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.02 
 
 
742 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  30 
 
 
850 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  28.99 
 
 
759 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  29.94 
 
 
759 aa  244  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.29 
 
 
724 aa  244  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  29.58 
 
 
1072 aa  244  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  29.65 
 
 
727 aa  244  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  29.52 
 
 
727 aa  244  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  30.38 
 
 
1037 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  31.1 
 
 
743 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0628734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>