More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1434 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2387  chorismate synthase  96.87 
 
 		 383 aa  743    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1434  chorismate synthase  100 
 
 		 383 aa  786    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1114  chorismate synthase  75.7 
 
 		 395 aa  625  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0181  chorismate synthase  74.29 
 
 		 399 aa  597  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2640  chorismate synthase  72.07 
 
 		 415 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  50.69 
 
 		 365 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  47.7 
 
 		 366 aa  335  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  47.67 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  50.98 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  47.4 
 
 		 358 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  49.58 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  49.58 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  49.3 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  46.89 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  44.85 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  48.46 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  49.3 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  47.18 
 
 		 364 aa  313  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  50.56 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  49.44 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  49 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  48.18 
 
 		 362 aa  308  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  47.04 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  46.67 
 
 		 352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  48.74 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  46.59 
 
 		 360 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  45.73 
 
 		 355 aa  307  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  47.46 
 
 		 359 aa  305  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  46.88 
 
 		 360 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  46.02 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  46.37 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  44.93 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  45.53 
 
 		 369 aa  300  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  45.66 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  47.19 
 
 		 458 aa  295  8e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  48.73 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  47.08 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  45.92 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  45.2 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  45.2 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  45.92 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  45.88 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  45.88 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  45.88 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  45.88 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.35 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  47.18 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  46.09 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  45.17 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  44.59 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  45.6 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  48.45 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  46.2 
 
 		 368 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  46.78 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  46.33 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  48.03 
 
 		 361 aa  285  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  45.75 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  43.78 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  43.31 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  44.93 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  44.17 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  46.33 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  39.79 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  44.51 
 
 		 371 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  42.42 
 
 		 365 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  44.51 
 
 		 366 aa  282  9e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  44.95 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  44.26 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  45.33 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  44.29 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  46.17 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  42.74 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  45.25 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  44.2 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  46.61 
 
 		 351 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  45.33 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  43.99 
 
 		 367 aa  279  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  44.9 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  45.41 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  45.41 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  43.98 
 
 		 366 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  44.23 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  44.94 
 
 		 361 aa  277  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  45.88 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  45.36 
 
 		 364 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  44.59 
 
 		 361 aa  275  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  43.41 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  43.41 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  43.65 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  42.9 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  42.94 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  38.07 
 
 		 373 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  43.02 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  44.35 
 
 		 353 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  45.26 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  45.63 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  45.63 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  45.26 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  45.26 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  45.26 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>