245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18410 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
493 aa  960    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  51.32 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  52.39 
 
 
510 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  47.11 
 
 
502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  47.26 
 
 
502 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  47.64 
 
 
488 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  47.52 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  47.52 
 
 
503 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  47.43 
 
 
527 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  47.52 
 
 
503 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  47.54 
 
 
486 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  45.92 
 
 
498 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  46.75 
 
 
488 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  45.34 
 
 
498 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  45.17 
 
 
506 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  44.56 
 
 
508 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  44.35 
 
 
508 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  46.53 
 
 
499 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  44.56 
 
 
508 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  44.56 
 
 
508 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  45.62 
 
 
508 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  44.35 
 
 
508 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  45.74 
 
 
508 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  44.35 
 
 
508 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  45.96 
 
 
508 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  43.52 
 
 
508 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  44.35 
 
 
508 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  45.23 
 
 
495 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  44.94 
 
 
497 aa  413  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  47.72 
 
 
494 aa  409  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  45.22 
 
 
517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  45.44 
 
 
503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  45.93 
 
 
505 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  44 
 
 
514 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  44.76 
 
 
502 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  44.25 
 
 
498 aa  381  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  42.51 
 
 
547 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  44.23 
 
 
525 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  39 
 
 
499 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  40.21 
 
 
524 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  39.56 
 
 
547 aa  342  8e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  38.84 
 
 
520 aa  323  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  38.59 
 
 
553 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  39.7 
 
 
493 aa  302  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.42 
 
 
453 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  32.78 
 
 
458 aa  230  4e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
431 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  32.85 
 
 
476 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.05 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.27 
 
 
468 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  32.39 
 
 
454 aa  212  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.74 
 
 
446 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  34.76 
 
 
446 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  35.81 
 
 
457 aa  209  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 
437 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  34.55 
 
 
446 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  34.33 
 
 
446 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  34.12 
 
 
446 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  34.12 
 
 
446 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  30.77 
 
 
518 aa  206  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  34.12 
 
 
446 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  34.33 
 
 
446 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  34.76 
 
 
446 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.75 
 
 
452 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  34.55 
 
 
446 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  31.72 
 
 
461 aa  203  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.39 
 
 
455 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  32.03 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  32.9 
 
 
446 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  33.05 
 
 
447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  34.29 
 
 
454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  34.66 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  32.82 
 
 
459 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  34.43 
 
 
460 aa  196  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 
448 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  38.44 
 
 
442 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 
452 aa  196  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  32.75 
 
 
458 aa  196  9e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  31.79 
 
 
456 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  31.25 
 
 
447 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  30.57 
 
 
486 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  32.13 
 
 
484 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  31.44 
 
 
447 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  37.8 
 
 
475 aa  195  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  33.33 
 
 
453 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.57 
 
 
453 aa  192  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.52 
 
 
455 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47656  hypothetical protein  34.19 
 
 
1166 aa  192  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0223254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.52 
 
 
455 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  31.61 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  32.27 
 
 
447 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  31.56 
 
 
453 aa  191  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  32.27 
 
 
447 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 
435 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  30.02 
 
 
447 aa  188  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  36.41 
 
 
458 aa  189  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1223  SNF family Na(+)-dependent transporter  31.88 
 
 
449 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  32 
 
 
447 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  30.28 
 
 
462 aa  188  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  32.27 
 
 
457 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>