More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03880 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_03880  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  48.58 
 
 		 270 aa  205  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  48.8 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  47.37 
 
 		 295 aa  201  8e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  50.5 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  48.11 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 264 aa  198  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  46.86 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  43.93 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  48.11 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  47.17 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  43.96 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  47.14 
 
 		 305 aa  194  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  47.78 
 
 		 246 aa  194  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  47.78 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  46.01 
 
 		 269 aa  193  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  47.14 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  47.29 
 
 		 247 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  46.95 
 
 		 253 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  47.52 
 
 		 277 aa  192  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  43.93 
 
 		 275 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  44.08 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  46.57 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  46.48 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  45.75 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  46.01 
 
 		 281 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  46.01 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  45.07 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  48.78 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  45.24 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  43.19 
 
 		 276 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  42.72 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  43.96 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  43.66 
 
 		 286 aa  188  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 277 aa  188  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 281 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  42.51 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0721  hydrogenase accessory protein HypB  44.6 
 
 		 270 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  43.81 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  43.81 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  46.53 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  43.13 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  44.08 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  42.18 
 
 		 297 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  45.05 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  45.69 
 
 		 266 aa  185  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  40.95 
 
 		 296 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  45.5 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  44.13 
 
 		 283 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  42.86 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  45.07 
 
 		 282 aa  184  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  41.31 
 
 		 352 aa  184  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2482  hydrogenase accessory protein HypB  42.58 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  46.8 
 
 		 244 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  41.78 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  44.39 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  43.93 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  43.81 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  43.33 
 
 		 281 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  45.54 
 
 		 407 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  42.52 
 
 		 301 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.92 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  42.18 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  42.92 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  43 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  42.92 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  40.85 
 
 		 268 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  42.06 
 
 		 312 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  43.22 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  43.46 
 
 		 269 aa  181  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  44.5 
 
 		 267 aa  181  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  42.51 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  43.33 
 
 		 250 aa  181  9.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  45.02 
 
 		 293 aa  180  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  41.59 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  42.25 
 
 		 326 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  45.37 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  43.81 
 
 		 322 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  43.27 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  46.23 
 
 		 268 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  43.78 
 
 		 288 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  40.8 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  44.83 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  42.72 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  44.76 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  40.19 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  43.14 
 
 		 246 aa  178  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3017  hydrogenase accessory protein HypB  42.18 
 
 		 217 aa  177  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  41.23 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  44.83 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  42.72 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  42.79 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  44.13 
 
 		 394 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  42.72 
 
 		 284 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  42.25 
 
 		 307 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>