211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03850 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_03850  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  100 
 
 
334 aa  696    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1939  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  44.96 
 
 
375 aa  248  8e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0806  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  44.11 
 
 
375 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1070  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  41.37 
 
 
299 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.640401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0111  [Ni/Fe] hydrogenase, group 1, small subunit, putative  35.94 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.2309  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_121  Ni/Fe hydrogenase, small subunit  35.31 
 
 
354 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0257  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  35.31 
 
 
354 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1970  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.92 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1041  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.7 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.225928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1232  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  33.44 
 
 
309 aa  185  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.742919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1908  hydrogen:quinone oxidoreductase  37.45 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.935417  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0872  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  32.36 
 
 
377 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2953  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  32.79 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3332  Ni-Fe hydrogenase, small subunit:twin-arginine translocation pathway signal  32.25 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0545  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  31.82 
 
 
373 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1123  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  37.8 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1249  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  32.28 
 
 
317 aa  178  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.187763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1922  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.7 
 
 
378 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2404  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.7 
 
 
378 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0274072  hitchhiker  0.000408774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1889  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.7 
 
 
378 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.118271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1915  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.7 
 
 
378 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0904727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3139  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  37.01 
 
 
368 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2134  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  34.38 
 
 
294 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1822  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.7 
 
 
378 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.249477  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2155  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.7 
 
 
378 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.021449  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0144  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  37.25 
 
 
376 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2099  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, small subunit precursor  36.7 
 
 
378 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2088  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.33 
 
 
378 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332576  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1880  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.33 
 
 
378 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1765  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  35.58 
 
 
378 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0782  nickel-dependent hydrogenase, small subunit  37.65 
 
 
367 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0547122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1679  hydrogen:quinone oxidoreductase  36.33 
 
 
378 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2033  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.33 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000339723  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3906  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  37.74 
 
 
375 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2103  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.7 
 
 
378 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3755  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  37.04 
 
 
321 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1943  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  37.55 
 
 
378 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162149  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1903  thymidylate kinase (dTMP kinase)  35.58 
 
 
381 aa  170  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0537168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0837  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  38.93 
 
 
367 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2056  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  33.33 
 
 
373 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0767  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  32.69 
 
 
319 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0265  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  38.26 
 
 
317 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.595947  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1283  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  35.06 
 
 
360 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0034668  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0458  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  35.06 
 
 
379 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000404232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2137  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  33.55 
 
 
317 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4088  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  33.67 
 
 
393 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.541909  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1403  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  34.32 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0861  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase small chain  34.08 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.822531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3974  Ni-Fe hydrogenase, small subunit:twin-arginine translocation pathway signal  33.22 
 
 
394 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871152  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0719  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  36.26 
 
 
324 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3772  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  33.91 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.427783  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00346  Ni-Fe hydrogenase, small subunit  33.22 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1162  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  35.47 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0940  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase small chain  35.21 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0025548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0274  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  32.28 
 
 
317 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3148  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  31.82 
 
 
417 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0526  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  29.97 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428273  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0712  Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  33.56 
 
 
379 aa  162  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2038  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  36.51 
 
 
813 aa  162  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1732  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.54 
 
 
322 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1996  uptake hydrogenase small subunit precursor  35.5 
 
 
363 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0123  nickel-dependent hydrogenase, small subunit  31.49 
 
 
361 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.799752  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0101  putative periplasmic protein  35.69 
 
 
401 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3523  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  31.41 
 
 
369 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1436  Ni-Fe hydrogenase, small subunit  35.58 
 
 
383 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3376  hypothetical protein  36.26 
 
 
368 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1154  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  33.22 
 
 
370 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1446  Ni-Fe hydrogenase, small subunit  32.84 
 
 
362 aa  159  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123847  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1150  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.73 
 
 
358 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172681  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2319  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  33.94 
 
 
415 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3397  hydrogenase 2 small subunit  34.12 
 
 
372 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1298  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  33.21 
 
 
364 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102659  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3323  hydrogenase 2 small subunit  34.12 
 
 
372 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629462  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3332  hydrogenase 2 small subunit  34.12 
 
 
372 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3403  hydrogenase 2 small subunit  34.12 
 
 
372 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1975  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  33.59 
 
 
364 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3498  hydrogenase 2 small subunit  34.12 
 
 
372 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.271513  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4309  hydrogenase 2 small subunit  34.46 
 
 
372 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02873  hydrogenase-2, small chain  34.46 
 
 
372 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0699  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.46 
 
 
372 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02822  hypothetical protein  34.46 
 
 
372 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3466  hydrogenase 2 small subunit  34.46 
 
 
372 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3177  hydrogenase 2 small subunit  34.46 
 
 
372 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0696  hydrogenase 2 small subunit  34.46 
 
 
372 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3403  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.16 
 
 
400 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3424  hydrogenase 2 small subunit  34.46 
 
 
372 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3283  hydrogenase 2 small subunit  34.46 
 
 
372 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2173  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.35 
 
 
370 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00215445  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0271  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  32.57 
 
 
317 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.113366 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0853  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  29.74 
 
 
364 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113934  normal  0.390076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2827  hydrogenase (acceptor)  33.21 
 
 
364 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1106  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.57 
 
 
385 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.978131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3989  Ni-Fe hydrogenase, small subunit:twin-arginine translocation pathway signal  33.97 
 
 
363 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1246  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  33.88 
 
 
317 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7265  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  31.88 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.303064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0338  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.34 
 
 
373 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000709279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1269  Hydrogenase (acceptor)  30.38 
 
 
355 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0054  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  34.36 
 
 
356 aa  152  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000250606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50590  Uptake hydrogenase small subunit (Precursor), HoxK  34.35 
 
 
358 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3097  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  35.5 
 
 
361 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>