52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01880 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 
236 aa  480  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  55.98 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  50.66 
 
 
234 aa  235  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  46.9 
 
 
234 aa  221  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  52.66 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  52.42 
 
 
235 aa  217  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  52.4 
 
 
242 aa  216  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  47.41 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  47.41 
 
 
243 aa  211  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  44.98 
 
 
236 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  46.54 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  44.78 
 
 
234 aa  190  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  44.4 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  41.08 
 
 
243 aa  181  9.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  45.97 
 
 
243 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  41.23 
 
 
237 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  35.24 
 
 
236 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  37.02 
 
 
239 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  35.15 
 
 
550 aa  151  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  30.25 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  27.47 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  26.58 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  26.72 
 
 
241 aa  72  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  33.09 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  23.65 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  23.33 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  29.09 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  27.41 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  23.58 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  23.92 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  24.15 
 
 
237 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  24.62 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  26.47 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  20.56 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  22.71 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  22.82 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  21.79 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  22.71 
 
 
237 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  22.71 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  22.71 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  22.71 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  22.71 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  26.7 
 
 
223 aa  47  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  22.22 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  24.86 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  23.33 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  22.33 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  23 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  28.07 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  24.02 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  26.79 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>