More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6782 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6782  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  250  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4173  response regulator receiver protein  40 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0641  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0616  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0650  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0660  response regulator receiver protein  35 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 604 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 309 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1834  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00302805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2384  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  30.25 
 
 		 1121 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.15 
 
 		 466 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 225 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1967  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3631  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.222558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  33.87 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0915  CheA signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 584 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1641  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126042  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  37.5 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  32.77 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  30.48 
 
 		 1156 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  31.93 
 
 		 221 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  29.27 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29 
 
 		 1129 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.82 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  34.48 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  29.31 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3743  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 724 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.52 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  30.95 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 		 932 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  36.67 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 873 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1002 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.61 
 
 		 1193 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 964 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 830 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  30.16 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 700 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  32.08 
 
 		 922 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1739  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.75 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  30 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1528  adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 		 593 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  29.63 
 
 		 927 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  33.62 
 
 		 693 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  29.63 
 
 		 927 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 833 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  28.1 
 
 		 1374 aa  55.1  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0247  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 467 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  32.08 
 
 		 934 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1905  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1180 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 645 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 777 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2297  CheA signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 799 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 363 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 934 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2983  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 1167 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 395 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 559 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 937 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  33.62 
 
 		 734 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0984  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  35.45 
 
 		 669 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 706 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 937 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  30 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  32.77 
 
 		 1346 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  31.71 
 
 		 301 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  30.83 
 
 		 1100 aa  53.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 721 aa  53.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>