64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4296 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  100 
 
 		 133 aa  259  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  49.15 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  52.25 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  49.53 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  46.85 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  44.86 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  41.32 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  43.97 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  45.05 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  35.04 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  37.84 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  38.58 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  47.44 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  37.96 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  39.5 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  35.04 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  27.93 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  35.25 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  33.03 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  33.03 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  37.08 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  33.64 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  38.83 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  39.53 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  35.9 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  37.5 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  41.67 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  36.78 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  34.15 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  41.33 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  41.33 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  32.17 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  33.04 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  33.9 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  39.09 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  37.72 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  33.9 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  35.29 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  39.67 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  35.19 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  35.19 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  32.58 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  35.19 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  36.54 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  30.3 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  33.59 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  41.86 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  31.68 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  27.05 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  38.52 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0545  hypothetical protein  29.06 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  31.71 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0720  hypothetical protein  34.43 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  33.04 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  36.46 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  36.61 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  34.62 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  35.45 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0844  DoxX family protein  37.5 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450101  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  35.9 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>