54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5051 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  226  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  53.15 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  52.25 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  42.99 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  46.96 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  47.06 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  45.05 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  39.81 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  44.14 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  50 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  38.1 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  39.45 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  43.66 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  31.19 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  31.19 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  39.47 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  35.05 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  33.67 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  36.96 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  32.65 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  34.52 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  37.66 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  36.56 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  38.03 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  31.63 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  36.63 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  31.13 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  35.14 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  34.34 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  32.41 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  34.86 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  36.76 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  33.91 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  33.02 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  30.69 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  30.48 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  33.82 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  34.34 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  28.87 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  40.51 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  34.04 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  39.13 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  33.94 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0720  hypothetical protein  36.67 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  31.96 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  32.67 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  31.96 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0545  hypothetical protein  29.06 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  30.69 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>