34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2171 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  100 
 
 
116 aa  229  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  229  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  73.28 
 
 
116 aa  170  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  35.71 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  38.39 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  33.03 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  36.89 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  31.19 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  34.48 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  36.19 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  28.57 
 
 
150 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  29.52 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  30.93 
 
 
175 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  32.43 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  31 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  28.97 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  30.3 
 
 
140 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  33.94 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  31.78 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  31.31 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  41.44 
 
 
121 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  29.9 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  34.09 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  35 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  33.75 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  29.29 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  32.38 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  35.82 
 
 
131 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  27.59 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  29.85 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  29.73 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  31.82 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  36.59 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  31.68 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>