30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3824 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  98.6 
 
 
143 aa  273  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  97.9 
 
 
162 aa  271  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  70.08 
 
 
148 aa  181  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  60.53 
 
 
118 aa  146  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  57.26 
 
 
138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  58.12 
 
 
124 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  54.1 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  58.33 
 
 
141 aa  138  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  56.41 
 
 
129 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  59.38 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  52.03 
 
 
129 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  59.18 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  50.45 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  41.03 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  40.71 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  32.97 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  36.84 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  35.19 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  35.54 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  32 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  39.45 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  35.51 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  38.53 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  37.18 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  33.88 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  37.21 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  32.2 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  36.59 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>