32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3443 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  316  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  76.97 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  73.08 
 
 		 147 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  53.23 
 
 		 168 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  51.64 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  50 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  52.71 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  50 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  50 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  39.06 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  37.86 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  33.64 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  38.89 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  31.71 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  31.53 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  34.75 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  33.73 
 
 		 118 aa  51.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  33.33 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  33.93 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  29.13 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  39.74 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  27.48 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  34.88 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  26.77 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  27.45 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  30.28 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  30.83 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  33.03 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  32.74 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  31.17 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>