42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2150 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  100 
 
 		 147 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  73.08 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1934  hypothetical protein  72.22 
 
 		 144 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  57.38 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  51.88 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  50.74 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  51.13 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  49.21 
 
 		 168 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  50.79 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  40.94 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  35.9 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  32.73 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  48.72 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  34.91 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  32.41 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  32.67 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  35.14 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  32.77 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  32.91 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  31.53 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  30.28 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  28.97 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  28.97 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  31.25 
 
 		 117 aa  47.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  29.66 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  27.83 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  29.84 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  34.23 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  33.88 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  28.12 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  35.19 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  31.62 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  29.51 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  33.91 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  32.46 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  32.17 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  31.37 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>