36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01390 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  100 
 
 		 148 aa  292  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  70.08 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  69.29 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  69.29 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  62.02 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  62.81 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  57.81 
 
 		 138 aa  151  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  62.5 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  57.26 
 
 		 124 aa  146  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  57.5 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  56.64 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  58.72 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  56.3 
 
 		 129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  58.99 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  34.17 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  32.79 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  35.04 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  35.59 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  36.22 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  34.75 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  34.07 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  32.06 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  35.06 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  34.75 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  34.82 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  33.62 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  30.3 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  39.24 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  37.65 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  30.17 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  29.84 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  29.5 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  32.67 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  30.12 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  34.12 
 
 		 134 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>