27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3627 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  271  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  62.59 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  62.59 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  61.22 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  59.71 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  55.36 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  57.14 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  54.7 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  62.2 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  51.26 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  49.19 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  55.56 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  52.1 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  40.62 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  39.29 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  36.8 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  40.18 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  35.04 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  34.88 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  29.37 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  35.14 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  32.53 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  34.11 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  33.64 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>